瀛海鎮原屬“南海子”一部分，為元、明、清三代帝王行圍狩獵的范圍。清光緒二十八年準令開墾“南海子”內大片土地，由皇宮內太監在此圈占土地，開設私莊，從河北河間、肅寧等縣招來大批貧苦百姓為他們開墾耕種，故在此形成一個個村落。鎮界南有晾鷹臺，為元之鷹坊仁虞院，在清康熙《大興縣志》中稱其為大興“八景之一”。《南囿秋風》詩中寫道：“落雁遠驚云外浦，飛鷹欲下水邊臺”。今臺基尚存，其上樹木成林，一片蔥郁，列為區級文物保護單位。鎮域南側建有北普陀影視城。
2022年10月，2022年淘寶鎮名單發布，瀛海鎮（瀛海地區）上榜。
2021年10月，南京大學空間規劃研究中心、阿里研究院聯合發布2021年淘寶鎮名單，瀛海鎮（瀛海地區）榜上有名。
民國三十五年（1946年），瀛海地區屬河北省大興縣南苑區團河鄉。
民國三十五年（1946年）12月，瀛海地區屬北平市第二十三區，后屬第十四區。
1952年，瀛海地區屬南苑區。
1956年，瀛海地區屬南苑區紅星集體農莊。
1958年，瀛海地區屬紅星人民公社瀛海大隊。
1984年，瀛海地區屬北京南郊農場瀛海分場。
1984年，瀛海地區屬紅星區瀛海鄉。
2000年3月22日，與太和鄉合并成立瀛海鎮。
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