西三旗街道成立于2000年3月。2002年,由原來的29個社區增加到30個社區,與東升地區劃分了轄區。西三旗街道辦事處駐北京市海淀區清河龍崗路6號,面積8.7平方千米,總人口144126人(2010年)。
2022年2月,西三旗街道被確定為2021-2022年度北京市衛生街道。
2019年12月,第三批智慧健康養老示范街道(鄉鎮)名單公布,西三旗街道榜上有名。
自1949年北京(時稱北平)和平解放以來,西三旗曾劃歸原第十四區,1952年劃歸原東郊區,1956年劃入海淀區。
2000年3月,新建的西三旗街道辦事處正式成立,地名沿用至今。
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