(略) 疾病預防控制中心的“三代基因測序儀”采購

方案征集公告

各儀器設備廠家、經營單位：

(略) 疾病預防控制中心計劃采購一臺三代基因測序儀，為了全面了解不同廠家、不同型號的設備性能、配置、使用成本、市場價格等情況，根據《中華人民共和國政府采購法》等法律法規的要求，本著“公平、公開、公正”的原則，對本次實施采購的設備進行采購方案征集工作，特邀貴單位本著誠心讓利優惠的原則參與。采購方將組織專家小組對各單位所提供的選型方案及設備技術、性能、價格等情況進行綜合評定，并結合工作需求確定性價比最優的設備選型方案參考為采購方案實施政府采購。現將具體事項通知如下：

三代基因測序儀采購需求：

1.項目名稱：三代基因測序儀

2.預算金額：*元人民幣

3.技術要求：為保證單位業務正常開展，各廠商所投產品必須滿足可用于微生物（包括細菌、病毒和各類真菌甚至病原蟲等）的測序檢測，可以實現快速物種鑒定、溯源分析與耐藥、毒力分析等。

1、測序儀主機

1.直接測序DNA/RNA樣本，無需通過PCR 擴增；

2.單次可同時運行≥2張測序芯片；

3.單張芯片產出≥120Gb；

4.單次準確率：單序列準確率≥99%；

5.測序時長：1min-72h內可隨時中斷，且芯片可重復利用；

6.起始樣品總量10pg-1ug；

7.可用于全長16S測序進行微生物群落分析；可用于轉錄組全長測序，測序結果無需拼接，可直接分析轉錄本可變剪切模式；

8.最快建庫時間≤10min；

9.可通過結合Barcode實現擴增子的Multiplex測序，可提供≥96種Barcode序列；

10.可進行單細胞測序且有完整成熟的實驗方案，并能提供詳細的實驗方案；

11.文庫上樣后如若芯片出現異常，可以把文庫回收用于下一次測序。

2、生信分析系統

2.1、新冠全基因組分析系統參數：

1.提供從下機數據到生信結果一鍵式圖形界面分析，無需分步操作；

2.支持二代（illumina、ion torrent和華大）和三代（Nanopore和Pacbio）測序下機數據的分析，允許fast5，fastq，barcode fastq以及對應壓縮包等多種數據格式直接導入分析，無 (略) 理；

3.提供新冠病毒全基因組組裝以及突變位點分析，突變位點表格包含突變位點位置、堿基變化、氨基酸變化、位點測序深度、支持數據比例和效應注釋信息；

4.內置基因組瀏覽器，支持可視化驗證位點突變真實性與模式，同時與突變位點表建立聯動機制，實現一鍵定位，無需手動輸入突變位點位置；

5.支持自建基因組本地數據庫，提供數據庫清空、樣本增減和meta信息編輯功能；

6.內置GISAID來源數據庫和本地自建數據庫，提供群體比較分析，結果展示變異比較列表、系統進化樹、序列同源性、共享SNP數量、獨享SNP、缺失位置和插入位置；

7.提供新冠病毒全基因組下采樣式覆蓋度、正負鏈覆蓋圖和引物池覆蓋圖，獲知基因 (略) 域測序深度，統計不同測序深度位點，提示序列完整性；

8.提供污水新冠監測模塊，可獲得不同分型比例信息，突變信息以及一致性序列；

9.提供fast5轉fastq（3種轉換模式）、自定義barcode拆分、接頭和barcode序列去除、fastq/fasta相互轉換、序列合并與拆分、序列轉換、序列挑選、序列條件過濾、bed位置提取、比對位置分析等功能，以圖形界面形式實現；

2.2、流感全基因組分析系統參數：

1.一個主機允許多個用戶端，支持主流系統（liunx系統、windows系統、MAC系統） (略) IP訪問，保證數據安全性及使用便利性，以圖形界面實現；

2.支持用戶在線和離線一鍵升級系統，無需命令行操作；

3.支持二代（illumina、ion torrent和華大）和三代（Nanopore和Pacbio）測序下機數據的分析，允許fast5，fastq，barcode fastq以及對應壓縮包等多種數據格式直接導入分析，無 (略) 理；

4.提供流感病毒全基因組組裝以及突變位點分析，包含突變位點位置、堿基變化、位點測序深度和雜合情況信息；

5.內置IGV基因組瀏覽器，支持可視化驗證位點突變模式；

6.提供****四種流感病毒鑒定，*流亞型鑒定，*流支系鑒定以及clade詳細分型；

7.內置流感數據庫，基于HA和NA基因提供群體比較分析，支持本地數據導入共同分析，結果以變異比較列表和系統發育樹的方式展示；

8.提供流感病毒全基因組覆蓋度圖，獲知基因 (略) 域測序深度，統計不同測序深度位點，提示序列完整性；

2.3、廣譜病原微生物及耐藥分析系統參數：

1.支持用戶在線和離線一鍵升級系統，無需命令行操作；

2.支持二代（illumina、ion torrent和華大）和三代（Nanopore和Pacbio）測序下機數據的分析，允許fast5，fastq，barcode fastq以及對應壓縮包等多種數據格式直接導入分析，無 (略) 理；

3.支持單樣本和多樣本測序數據自定義導入分析，提供樣本名稱編輯功能；

4.支持16s rDNA全長擴增子測序數據分析，搭載臨床級數據庫，提供比對質量分布和比對長度覆蓋圖，確定鑒定結果真實性；

5.支持宏基因組分析，可同時檢測≥*種物種信息條目，包括病毒、細菌、真菌、原蟲、古菌等；

6.提供物種分類、NCBI物種號、相對豐度、人間傳染的病原微生物目錄和致病性信息，以及所有物種序列下載功能；

7.提供耐藥元件鑒定、耐藥機理和耐藥藥物鑒定等分析以及毒力元件鑒定和毒力機理等分析；

8.支持自建病原序列本地數據庫，提供blast和mapping兩種序列比較方法；

9.內置病毒亞型數據庫，支持分析所有呼吸道和腸道病毒亞型；

10.提供樣本管理系統，支持輸入樣本的具體信息，包括樣本病案信息、取樣信息、臨床診斷信息，支持樣本信息和數據分析管理關聯等。

2.4、致病菌分析系統：

1.提供從下機數據到生信結果一鍵式圖形界面分析，無需分步操作；

2.支持二代（illumina、ion torrent和華大）和三代（Nanopore和Pacbio）測序下機數據的分析；

3.允許fast5，fastq，barcode fastq以及對應壓縮包等多種數據格式直接導入分析，無 (略) 理；

4.支持單樣本和多樣本測序數據自定義導入分析，提供樣本名稱編輯功能；

5.支持IGV查看測序原始數據比對情況，同時也可以查看位點的突變情況；

6.支持組裝結果評估，對組裝結果進行統計，提供是否成環和checkM評估結果；

7.提供樣本管理系統，支持輸入樣本背景信息，包括樣本病案信息、取樣信息、臨床診斷信息；

8.支持樣本信息和數據分析管理關聯；

9.支持一鍵輸出可打印的分析報告，支持分析數據及結果下載、圖表輸出、病例信息關聯等；

10.主機允許用 (略) 域網IP遠程訪問；

11.用戶可以實現在線和離線一鍵升級系統；

12.支持沙門氏菌、大腸桿菌、志賀氏菌、副溶血弧菌、霍亂弧菌、小腸結腸耶爾森菌和空腸彎曲桿菌7種致病菌，開展全基因組數據分析，每種菌都有獨立的分析操作界面；

13.支持沙門氏菌、大腸桿菌、志賀氏菌、副溶血弧菌、霍亂弧菌、小腸結腸耶爾森菌和空腸彎曲桿菌7種致病菌支持MLST分子分型和沙門、大腸等4種cgMLST分子分型；

14.支持自建數據庫溯源分析，支持構建進化樹。

2.5、組裝分析模塊：

1.提供從下機數據到生信結果一鍵式圖形界面分析，無需分步操作；

2.一個主機允許多個用戶端，支持主流系統（liunx系統、windows系統、MAC系統） (略) IP訪問，保證數據安全性及使用便利性，以圖形界面實現；

3.支持用戶在線和離線一鍵升級系統，無需命令行操作；

4.支持二代（illumina、ion torrent和華大）和三代（Nanopore和Pacbio）測序下機數據的分析，允許fast5，fastq，barcode fastq以及對應壓縮包等多種數據格式直接導入分析，無 (略) 理；

5.支持單樣本和多樣本測序數據自定義導入分析，提供樣本名稱編輯功能；

6.支持主流組裝軟件選擇，提供無參、有參和混合組裝三種組裝模式，組裝結果可在軟件界面直接查閱以及自定義保存；

7.基于有參組裝模式，提供全基因組突變位點分析，包含突變位點位置、堿基變化、位點測序深度和雜合情況信息；

8.提供樣本全基因組覆蓋度圖，獲知基因 (略) 域測序深度；

9.支持基因組組裝序列注釋，包含基因類型、基因名、基因位置、EC號、COG號和功能描述，提供gff，gbk等注釋文件；

10.支持耐藥分析，提供耐藥元件、耐藥機理和耐藥藥物鑒定結果；

11.支持毒力分析，提供毒力元件和毒力機理鑒定結果；

12.支持134種細菌多位點序列分型（MLST）分析，提供管家基因等位基因編號和菌株序列型；

13.提供結果數據做圖、統計功能以及圖表輸出功能；

14.提供樣本管理系統，支持輸入樣本的具體信息，包括樣本病案信息、取樣信息、臨床診斷信息，支持樣本信息和數據分析管理關聯等。

2.6、溯源分析模塊參數：

1.提供從下機數據到生信結果一鍵式圖形界面分析，無需分步操作；

2.一個主機允許多個用戶端，支持主流系統（liunx系統、windows系統、MAC系統） (略) IP訪問，保證數據安全性及使用便利性，以圖形界面實現；

3.支持用戶在線和離線一鍵升級系統，無需命令行操作；

4.支持二代（illumina、ion torrent和華大）和三代（Nanopore和Pacbio）測序下機數據的分析，允許fast5，fastq，barcode fastq，fasta以及對應壓縮包等多種數據格式直接導入分析，無 (略) 理；

5.支持單樣本和多樣本測序數據自定義導入分析，提供樣本名稱編輯功能；

6.支持多序列聯配，動態查閱候選位點異同，提供交互式差異位點統計表；

7.支持基因組相似性分析，提供進化熱圖；

8.支持系統發育樹和最小生成樹分析，可調整樹展示形式；

9.提供結果數據做圖、統計功能以及圖表輸出功能；

10.提供樣本管理系統，支持輸入樣本的具體信息，包括樣本病案信息、取樣信息、臨床診斷信息，支持樣本信息和數據分析管理關聯等；

3、配套工作站

工作站1：配置不低于： CPU數量≥2，核心數≥48核，線程數≥96； GPU數量≥1，顯存≥48Gb，CUDA核心≥*； 內存≥512G，固態硬盤≥8Tb；企業級機械硬盤容量≥60Tb； 顯示器≥ 27英寸；分辨率：≥1920*1080。

工作站2：配置不低于；內存≥128GB ，CPU:≥ i9系列；顯卡≥6G顯存系統盤：固態硬盤≥ 512G，數據盤: SATA硬盤≥4TB，≥ 27寸顯示器/鍵鼠。

4.回復意見的供應商資格：滿足《中華人民共和國政府采購法》第二十二條規定

5.回復意見要求：各響應單位根據采購人的采購需求，提供完整準確的項目方案，包括但不限于產品技術參數、數量、型號、品牌、制造商名稱、預算單價和總價，詳細售后服務的內容、形式、質保期、貨物技術性能優勢、技術加分條款或評分細則等。

6. 回復意見方式：

6.1采購單位電話：0796-*，采購單位郵寄地址： (略) (略) 吉州大道54號；郵件接收郵箱：*@*63.com。

6.2招標代理電話：*，招標代理郵寄地址： (略) (略) 井岡山大道222號曼哈頓廣場9棟1204室；郵件接收郵箱：*@*q.com。

7.回復意見截止時間：2023年12月13日24時前，超過截止時間不予受理。

8.組織專家論證時間:2023年12月14日9時。

9.項目有關信息的聯系方式：

采購單位：王先生 0796-*

采購代理：江西 (略)

10、免責聲明：本次采購方案征集工作僅作為采購前的采購需求論證依據，工作成果不構成采購人的履約承諾。

江西 (略)

2023年12月6日

采購需求方案征集回復函（格式）

項目名稱：三代基因測序儀

公司名稱：（蓋章）

聯系人：

聯系電話：

電子郵箱：

一、供應商資格

此處添加營業執照等資格條件要求的材料

二、采購設備清單

注：報價需為包干價，包括完成本項目所需的安裝費、運輸費、調試費、人工費、稅費等一切相關費用。

三、技術參數和商務要求

四、評分細則（重點是優勢技術加分條款）

五、其他意見

“三代基因測序儀”采購計劃表

“三代基因測序儀”報價表

供應商名稱： 單位：人民幣元

供應商名稱（加蓋公章）：

法定代表人簽名(或其委托的全權代表人）： 日期：

注：

1.配置參數：提供詳細的技術說明文檔；

2.供應價格：應包括貨物、運保費、裝卸費、安裝、管理費、材料、檢測、培訓、維護、利潤、稅金和政策性文件規定應計取的合法取費等各項費用。